阿贝西利的不良反应主要以中性粒细胞减少及腹泻为主。而且多出现在治疗的前三个周期，经过对症治疗及剂量调整之后，可以得到有效的缓解。
应在以下时间监测全血细胞计数，包括：开始阿贝西利治疗之前、治疗最初2个月内每2周1次、接下来2个月内每月1次以及出现临床指征时（肝功能检测也应按该频率同时进行）。 在开始治疗前，建议中性粒细胞绝对计数（ANC）应≥1500/mm³、血小板计数应≥100,000/mm³且血红蛋白应≥8g/dL。 *注：ANC 1 级：ANC＜LLN-1500/mm³ 2 级：ANC 1000-＜1500/mm³ 3 级：ANC 500-＜1000/mm³ 4 级：ANC＜500/mm³ 其他的副反应还包括：肝功能损害、间质性肺疾病、静脉血栓等毒副反应。
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